汽车人总司令官·擎天柱及领袖卫队和霸天虎的战斗还在持续着，因霸天虎科学参谋·震荡波的实验而被再现的远古塞博特恩生物：巨狰狞却发生了暴走，其中最为强悍的几只巨狰狞逃到了地球，虽然擎天柱等人历经艰辛终于封印了其中最强的恶鬼大帝·冲云霄，但却不得不回到和霸天虎的战场上，追击其余巨狰狞的任务就交给了被称为刀剑太保的两组新汽车人小队，他们从战国时代就沉睡在日本，现在将被人类的少年唤醒，阻止巨狰狞干部·四鬼众复活冲云霄的计划，保护具有神秘力量的传说之碟，并将全部的巨狰狞再度封印。

变形金刚系列动画主要讲述的是在遥远的宇宙中有一个星球--Cybertron.星球上有一种金属生命体，他们在近百万年间分化成正义的博派--汽车人和邪恶的狂派--霸天虎。两军进行了几百万年的战争，星球能源耗尽霸天虎追随汽车人来到了地球。飞船坠毁在一座火山中。四百万年后，火山爆发飞船的主计算机——显像1号启动，并按飞机和汽车的形态改造两军。战争在地球上展开，到了2000年，汽车人与霸天虎展开血战。汽车人的首领擎天柱向宇宙发布了消息，希望分散在在宇宙各处的汽车人沿发布的坐标加入他们。一直在远处等待任务的救援部队E